Google Summer of Codeavec Debian-Med !
17 mars 2008
Le projet Debian a été accepté comme organisation mentor pour le Google Summer of Code 2008, et deux des projets proposés ont trait à la bio-informatique.
Le projet Biological databases manager propose aux étudiants d'écrire un programme pour automatiser le téléchargement, la mise à jour et l'indexation de banques de données telles que GenBank, miRbase, Jaspar, REbase, etc. Le gestionnaire de banque de données tirera parti du grand nombre de programmes pour la bio-informatique déjà empaquetés dans Debian.
Le projet cran2deb propose aux étudiants de générer des paquets Debian à partir de paquets sources pour GNU R. Ce projet permettrait la distribution des paquets R de Bioconductor au format Debian.
Debian-Med fournira des mentors pour le projet Biological databases manager, et Dirk Eddelbuettel est le mentor du projet cran2deb. Debian-Med encourage vivement les étudiants à se porter candidat pour l'un ou l'autre projet.